Bioinformatics Expert - Genomics Specialist

Автоматический пересказ вакансии на русском. Полный текст на языке оригинала и форма отклика — на сайте работодателя.

Эксперт по биоинформатике для выполнения многошаговых задач научного анализа данных и создания эталонных вопросов для обучения AI-моделей. Контрактная удалённая работа с почасовой оплатой.

Задачи

• Выполнять реалистичные многошаговые задачи научного анализа данных в биоинформатике
• Составлять оригинальные вопросы по биоинформатике с точными и объективными ответами
• Выбирать и анонимизировать данные из публичных архивов (GEO, SRA/ENA, ArrayExpress, PRIDE, PDB, MGnify) или собственных лабораторных данных
• Использовать научное ПО, код и инструменты командной строки для воспроизводимых анализов и структурированных результатов
• Разрабатывать валидационный Jupyter-ноутбук на Python или R для воспроизведения правильных ответов
• Интерпретировать результаты в контексте биологических или трансляционных вопросов, чётко описывая допущения, неопределённость и выводы

Требования

• Степень магистра или PhD в биоинформатике, вычислительной биологии, геномике, статистической генетике, количественной биологии или смежной области
• Практический опыт анализа данных секвенирования и омикс-данных: RNA-seq, WGS/WES, variant calling, метагеномика или протеомика
• Опыт работы с инструментами samtools, bcftools, bedtools, BWA, Bowtie2, BLAST, Python (pandas, Biopython, pysam) или R/Bioconductor (DESeq2, edgeR, limma, GenomicRanges)
• Умение писать и запускать Jupyter-ноутбуки с точным воспроизведением работы
• Чёткое и точное научное письмо

Условия

• Контрактная занятость
• Оплата $90–$110 в час
• Удалённая работа
• Процесс отклика: загрузка резюме, AI-интервью по резюме, заполнение формы (20–30 минут)

Навыки

• Python
• R
• pandas
• Biopython
• pysam
• R/Bioconductor
• DESeq2
• edgeR
• limma
• GenomicRanges
• samtools
• bcftools
• bedtools
• BWA
• Bowtie2
• BLAST
• Jupyter
• RNA-seq
• WGS/WES
• variant calling
• метагеномика
• протеомика
• GEO
• SRA/ENA
• ArrayExpress
• PRIDE
• PDB
• MGnify