Research Software Engineer

Автоматический пересказ вакансии на русском. Полный текст на языке оригинала и форма отклика — на сайте работодателя.

Инженер-разработчик в лаборатории Goecks при онкоцентре Moffitt. Разработка open-source инструментов и пайплайнов для машинного обучения в биомедицинских исследованиях (Galaxy, AnVIL).

Задачи

• Разрабатывать информатические инструменты и пайплайны анализа для ML-анализа геномных, клинических и imaging-данных
• Готовить документацию и поддерживать пользователей, чтобы исследователи могли работать с инструментами
• Поддерживать структурированные и прозрачные наборы данных и базы данных, пригодные для машинного обучения
• Интегрировать инструменты биоинформатики и ML с данными
• Поддерживать стандарты software engineering: требования, дизайн, код, тесты, качество, релизы
• Администрировать вычислительную инфраструктуру и управлять базами данных
• Участвовать в планировании и реализации программных инструментов совместно с командой
• Обучать новых сотрудников и быть ресурсом для других проектов
• Поддерживать QA-программу программных инструментов

Требования

• Опыт разработки ПО (минимум 2 года)
• Степень бакалавра минимум
• Сильное знание Python
• Опыт с другими языками: R, Perl, C#, Java
• Опыт использования open-source библиотек для ML и deep learning
• Опыт разработки веб- или научного ПО с несколькими компонентами и базой данных
• Знание структур данных, анализа производительности и CI
• Опыт разработки пайплайнов анализа и ML-анализов
• Умение работать в мультидисциплинарной команде

Условия

• Работа в Moffitt Cancer Center, Тампа, Флорида
• Участие в open-source проектах Galaxy и AnVIL
• Возможность развивать техническое лидерство
• Обучение ML, cloud computing, distributed computing и data engineering
• Коллаборация с инженерами, data scientists, биологами и врачами

Навыки

• Python
• R
• Perl
• C#
• Java
• Machine Learning
• Deep Learning
• Cloud Computing
• Distributed Computing
• Data Engineering
• CI
• Galaxy
• AnVIL