Senior Bioinformatics Research Engineer

Автоматический пересказ вакансии на русском. Полный текст на языке оригинала и форма отклика — на сайте работодателя.

Senior-инженер в команду биоинформатической research-разработки Freenome. Разрабатывает и масштабирует платформу и пайплайны для анализа данных секвенирования в исследованиях ранней диагностики рака.

Задачи

• Работать на стыке вычислительной биологии, ML-исследований, разработки ПО и биологических данных
• Возглавить разработку фреймворка биоинформатической research-разработки и внутренних инструментов
• Строить решения с учётом роста и масштабирования при переходе от исследований к продуктовой разработке
• Разрабатывать надёжные и воспроизводимые пайплайны данных для исследований liquid biopsy
• Управлять интеграцией источников данных компании (лаборатория, биоинформатика, клиника) для мультиомиксного анализа
• Повышать надёжность и масштабируемость научной платформы
• Разрабатывать ПО и workflow в поддержку долгосрочного видения биоинформатических исследований и продакшена
• Обеспечивать data-driven научные открытия в биологии и здравоохранении

Требования

• PhD в количественной области (вычислительная биология, онкобиология, статистика, биоинформатика, computer science) либо B.S./M.S. и эквивалентный опыт
• 4+ года опыта работы с биоинформатической инфраструктурой, автоматизацией и разработкой ПО
• Подтверждённый опыт реализации крупных технических проектов или анализов
• Сильные навыки программирования на Python или аналоге, опыт работы с крупномасштабными системами и большим числом пользователей
• Понимание основ биоинформатики: central dogma, молекулярная или онкобиология, знакомство с регуляторными процессами
• Опыт анализа данных NGS и биоинформатических пайплайнов
• Опыт работы с контейнеризированными облачными средами (Docker в GCP, Azure или AWS)
• Опыт работы в production-среде разработки ПО: автоматизированное регрессионное тестирование, контроль версий, системы деплоя
• Умение работать в тесной связке с лабораторными и вычислительными учёными, превращая научные роадмапы в конкретные продукты
• Способность работать в кросс-функциональной среде, где междисциплинарная коллаборация обязательна

Условия

• Гибридный формат в штаб-квартире в Брисбене, Калифорния (2-3 дня в неделю в офисе) либо удалённо
• Базовая зарплата в США: $161,925 - $227,325
• Equity, денежные бонусы и полный пакет медицинских, финансовых и прочих льгот
• Равные возможности трудоустройства и поддержка разнообразия

Навыки

• Python
• NGS
• Docker
• GCP
• Azure
• AWS
• bioinformatics
• machine learning
• statistics
• data pipelines
• distributed systems
• version control
• automated regression testing